1-اسهال 2-نفخ 3-برافروختگی 4-تحریک معده 5- سردرد 6- تهوع 7- سوزش سردل 8- بی خوابی 9- بوی بد دهان 10-تپش قلب 11- تحریک پوست (در صورت استعمال خارجی) 12- استفراغ 13- کاهش شدید فشارخون احتیاط و هشدار : 1- زنان باردار و شیرده، زنانی که تمایل به بارداری دارند، افرادی که برای درمان از دارو استفاده می کنند یا قرار است تحت عمل جراحی قرار گیرند، باید پیش از مصرف سیر، با پزشک خود مشورت کنند (برای زنان باردار و شیرده مصرف سیر توصیه نمی شود)

2- افرادی که داروهای رقیق کننده خون یا داروهای پایین آورنده قندخون مصرف می کنند، باید از مصرف زیاد سیر پرهیز کنند.

نکته 1 : ممکن است وقتی سیر را برای مصرف آماده می کنید، برخی ترکیبات فعال آن از بین بروند در این فرایند میزان ماده آلیسین موجود در سیر طبیعی ده برابر کم تر می شود. یکی از عوامل محدود کننده استفاده از سیر به عنوان یک ماده شفابخش بوی تند آن است که باعث می شود استفاده از آن عامل مخالف اصول اجتماعی تلقی شود. با این حال، می توان سیر را به غذا افزود یا از سیرخام در انواع سس خانگی بدون مواد نگهدارنده و چربی های اشباع شده جهت سالاد استفاده کرد. نکته 2 : اگر در خوردن سیر رعایت مزاج و طبیعت افراد نشود و مخصوصاً این گیاه به حالت خام و خیلی زیاد مصرف شود، برای دستگاه تنفس و بیماری همورویید مضر است. برای جلوگیری از ضررهای این گیاه توصیه می شود، سیر را در آب پخته و به آن کمی نمک، کره، و یا روغن بادام اضافه شود. استفاده از گیاه گشنیز، سکنجبین و آب انار همراه یا بعد از مصرف سیر نیز از مضرات آن می کاهد.